25-10-2022 OpenCitations Meta

Novità

• OC Meta ha processato 67,975 file su 70,785 e impiega 18 ore per processarne 3000. Fate voi i conti.

  • Ci sono stati 0 errori e 0 entità conflittuali stando ai log.
  • Allo stato attuale, che ormai approssima quello definitivo, i dati hanno il seguente peso:
    • Totale: 619,5 GB (140 GB compresso)
    • Triplestore: 536,4 GB
    • CSV: 34,6 GB
    • RDF (file individualmente zippati): 27,6 GB. Non ho idea di quanto possano pesare unzippati, ma si parla di TB
    • indici temporanei (si possono eliminare) e file di log: 18,5 GB
    • info dir: 2,3 GB

• Ho aggiunto una nuova regola ai campi minimi da specificare. Se una risorsa specifica il volume o il numero, il tipo di risorsa deve essere indicato. Ci sono tre possibilità: o è un articolo, o è un volume o è un numero. Se il tipo è ignoto, non è possibile capire a quale risorsa associare l’id, se al contenuto o al contenitore. Questa è la tabella dei campi obbligatori aggiornata:

  Untitled

  • Ho aggiornato la documentazione dei CSV presente su opencitations/metadata con la nuova regola
  • Questa regola viene violata 8 volte nel dump di Crossref. Ho corretto i documenti interessati a mano.

• Ho finalizzato il codice per aggiungere il fuso orario alla provenance di COCI.

  ⚠️

  L’archivio 2021-11-15T031921_0-4_1.zip del dump di provenance in formato csv e l’archivio 2021-11-15T031921_0-4_1-10.zip in formato nquads contengono dati e non provenance

  📌 La descrizione presente su Figshare del dump di provenance in formato CSV omette la descrizione di molti campi (snapshot, created, invalidated, description, update) e ne menziona uno inesistente, datatime. Invece, la descrizione del dump di provenance in formato nquads omette i campi “prov:invalidatedAtTime” e “oco:hasUpdateQuery”, forse perché non sono mai stati usati
  • Ho aggiunto dei test
  • Il codice si lancia da linea di comando
  • È sul mio repo personale di Github
  • Mi sono permesso di modificare la convenzione dei nomi dei file di provenance. Includevano i due punti, ad esempio “2019-10-21T22:41:20_1.csv”. Tuttavia, i due punti sono un carattere riservato su filesystem NTFS (non su ext).
    • Ho applicato ai nomi dei file la stessa convenzione già usata per i nomi degli archivi, sostituendo i due punti con trattino basso e usando come separatore del numero sequenziale il trattino, ad esempio “2019-10-21T22_41_20-1.csv”
  • I nuovi dati di provenance si trovano su oc-ficlit nelle directory /srv/meta/coci_prov_csv_tz e /srv/meta/coci_prov_nquads

• Ho aggiornato i materiali della seconda lezione di laboratorio

  • Invece di usare a e b come variabili, ho introdotto una narrativa basata sui pianeti per spiegare i vari concetti
  • Ho aggiunto alcune immagini eplicative per il tasto tab e le convenzioni sui nomi
  • Ho aggiunto un riferimento a PEP 8 per quanto riguarda le convenzioni sui nomi

• Ho completato il capitolo sullo stato dell’arte dell’articolo su OC Meta. Credo di avere un feticismo per le tabelle

  Untitled

Domande

• Devo aggiungere il fuso orario anche alla provenance di CCC e OCC?
• Aggiungere il fuso orario all’ultimo dump di COCI significa aggiungerlo a tutti i dump, perché, l’ultimo dump li comprende tutti. Ora bisogna modificare tutti gli upload aggiungendo, per ciascuna versione, solo gli archivi pertinenti. È un’operazione tediosa, se volete la faccio io.
• Bisogna modificare il codice che genera i nuovi dump perché aggiunga il fuso orario. Basta modificare oc_ocdm o c’è da toccare altro?
• Che differenza c’è tra NIH e PMC-OA?

Rubrica cose da pazzi

• https://doi.org/10.20546/ijcmas.2016.501.002
  • A parte i marquee, il link all’issue è javascript:history.go(-1)
  • Rivista indiana, la review viene fatta solo dal board editoriale entro 2 settimane
  • APC di 4000 Rupie (50$), ma se sei straniero paghi 100$
• 10.18782/2320-7051.2109 si commenta da solo
  • Sempre indiano